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Modèle d'étude : effet d'un antibiotique sur la microflore intestinale de l'Homme.
Et, ci-dessous : Représentation imagée de l'écologie microbienne in vitro et in vivo
General Design of the HFA Mice Trial for an Antibiotic Residue. (HFA mice: Human Flora Associated mice)

protocole HFA & residus antibiotique

Ecologie microbienne de l'intestin, in vitro (à gauche) et in vivo (à droite) Représentation imagée
Microbial Ecology of Gut Flora in a test tube (left) and in vivo (right)artist view

Ecologie microbienne de l'intestin in vivo et in vitro
Dans le tube à essai (à gauche), les bactéries se multiplient rapidement, car la densité est faible, les nutriments abondants, et il n'y a pas de compétition entre espèces : les expériences durent quelques heures. Dans le tube digestif, les densités bactériennes sont très importantes, les nutriments, en faible concentration, ne sont pas les même qu'in vitro et leur apport est discontinu, la pression partielle d'oxygène est très basse, la compétition entre espèces est intense, l'attachement à la paroi permet à certaines espèces d'échapper au transit, et l'évolution des populations peut se faire sur plusieurs jours ou plusieurs semaines. Toutes ces différences suggèrent que les modèles in vivo, comme "notre" souris HFA, sont de bien meilleurs modèles d'étude que les modèles in vitro, fussent ils des cultures continues en chémostat.
Dessins de Fabrice Castanet (étudiant véto en 1994, devenu fameux dessinateur humoriste vétérinaire Kastet ), pour Corpet & Brugère, Revue de Médecine Vétérinaire, 1995, 146, 2, 73-92
Drawings by Fabrice Castanet (vet student), for Corpet & Brugère, Rev. Med. Vet., 1995, 146, 2, 73-92
 Antimicrobial Agents & Chemotherapy, Antibiotic Selecting Dose for Resistant Bacteria
Free reprint on HAL: [Corpet et al., 1989, Minimum antibiotic levels for selecting a resistance plasmid in a gnotobiotic animal model.]
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